Création et mise en oeuvre d'outils bio-informatiques

Les outils bio-informatiques développés par AltraBio sont conçus afin de répondre à toutes les étapes de la recherche et du développement dans le but de transformer les vastes collections de données en connaissances accessibles et utiles :

+ Solutions de stockage, d'extraction et d'exploration de données et de connaissances accessibles sur le Web (WikiBioPath, APLims, etc.) :

  • WikiBioPath (Brochure, Vidéo) permet à ses utilisateurs d'analyser, d'intégrer et de comprendre leurs données expérimentales (microarrays, RNAseq, etc.). Il permet de rechercher des informations ciblées sur un gène, une protéine et leurs fonctions cellulaires à partir des informations disponibles sur des référentiels publics tels que MEDLINE. De plus, WikiBioPath est enrichi d'outils permettant la visualisation interactive des données afin que nos partenaires/clients puissent explorer leurs données expérimentales et les résultats de l'analyse statistique.
  • APLims est un système de gestion des informations de laboratoire. Afin de supporter les opérations de laboratoires courantes, il possède des propriétés spécifiques telles que :
    • un support de suivi du travail et des données générées
    • une interface d'échange de données
    • un cahier de laboratoire informatisé

+ Approches innovantes et développement d'outils et de méthodes sur fond propre afin d'améliorer les analyses de données.

  • Technologies "open source" actualisées (Ruby On Rails, Javascript (Jquery), HTML, PostgreSQL, MySQL, SQLite, R/BioConductor, etc.)
  • Compatibilité avec les solutions habituellement utilisées (Cytoscape, BioConductor, etc.)
  • Utilisation par Altrabio et ses partenaires/clients (scientifiques, bioinformaticiens, etc.)

+ AltraBio propose également une approche unique développée en interne permettant de reproduire votre stratégie de gating sur l’ensemble des fichiers de votre étude, libérant ainsi l’expérimentateur de cette tâche fastidieuse et chronophage. Cette approche a de nombreux avantages notamment dans les essais cliniques :

  • Standardisation de votre analyse
  • Augmentation de la fiabilité (reproductibilité et précision)
  • Elimination de la subjectivité/variabilité liées au gating manuel
  • Réduction du temps d'analyse